被病毒占领的人体：你的身体里，正住着3800000(2)

2017年，当时在圣迭戈州立大学（San Diego State University）工作的索菲·阮（Sophie Nguyen）和杰里米·巴尔（Jeremy Barr）证实了许多噬菌体能穿过一些器官表面的粘膜进入人体，并找到最后的定居位点。一些实验室研究证实，噬菌体能穿过人的肠道、肺部、肝脏、肾脏甚至脑部的粘膜。但是，一旦噬菌体随机地进入如中枢神经系统等几乎没有细菌存在的地方，它们可能无法进行复制并最终灭亡。

人体的病毒组

身体不同部位的病毒组会有很大不同。加利福尼亚大学圣迭戈分校的梅利莎·利（Melissa Ly）和我也证明了，通过比较没有血缘关系的人的病毒组，可以确定他们中是否有人住在一起。不同的人可能具有非常不同的病毒组，而同居的人似乎有约25％的病毒组相同。病毒不仅可以通过咳嗽等典型的传播方式在家庭成员之间传播，还可以通过日常接触、共享洗脸槽、马桶、桌子和食物传播。虽然我们只研究了一小部分人，但数据显示，没有恋爱关系的室友与情侣室友共享的病毒比例相当。亲密的接触似乎对此没有太多影响，只要住在同一个空间就足够了。

加利福尼亚大学圣迭戈分校的希拉·埃伯利斯（Shira Abeles）发现了男性和女性口腔中的病毒存在巨大差异，这可能是由二者体内不同的激素成分导致的，但没有人能证明两者存在联系。我们确实发现，由于地理位置的差异，不同人群的病毒组也会存在很大的差异。例如，西方国家人群的病毒组多样性会低于其他国家，这些差异可能与饮食和环境有关。

虽然人体内的许多病毒都会侵染细菌，但还有一小部分也能直接感染人体组织中的细胞。这些病毒可能只是少数，因为人体的免疫系统会抑制它们。当时任职于斯坦福大学的伊韦因·德·弗拉曼克（Iwijn De Vlaminck）证明，当一个人的免疫系统面临很大的挑战——例如当一个人因为接受器官移植，必须服用免疫抑制药物来避免器官排斥时，其体内特定类型的病毒会急剧增加。观察结果表明，在正常情况下，我们的免疫系统可以抑制病毒，但当人的免疫系统受到抑制时，病毒就会肆无忌惮地繁殖。

在新冠病毒中，我们也能看到这种机会主义。新冠病毒的感染者（特别是重症患者）很可能会出现并发症。最常见的是继发性细菌性肺炎（secondary bacterial pneumonia）或菌血症（bacteremia，由血液中细菌增多导致）。潜伏在人体内的病毒可能被重新激活，例如人类疱疹病毒第四型（Epstein-Barr virus）和巨细胞病毒（Cytomegalovirus）。当免疫系统集中于抵抗新冠病毒时，患者可能更容易受到其他病毒的危害。

尽管许多噬菌体是捕食者，但它们或许能和宿主细菌一直和谐相处，不会在细菌体内爆发。当一些噬菌体感染细菌时，它们会将其基因组整合到细菌的基因组中。尽管一些噬菌体会立即繁殖，杀死宿主细菌，但也有一些只是持续存在于宿主体内，就像进入了安静的休眠状态。

这可能是一种生存策略：当宿主细菌分裂时，需要复制自身的基因组，同时也会复制一份噬菌体的基因组。在这种模式下，宿主的生存决定了噬菌体的生存，所以噬菌体在维持宿主存活时，也会获得一定的益处。我们已经很清楚这种策略为何对噬菌体有利，但并不确定它是否对细菌有利。不管出于什么原因，人体内的许多细菌似乎已经习惯了和寄生的噬菌体生活在一起。

一些不太为人了解的病毒，一些可能是无害的，而它们几乎存在于每一个人的体内，如crAssphage